总算来到了琼华派，可是琼华派掌门夙瑶是个心机极重的人，非常妒才，尤其当她看到天河手中的望舒时决定利用天河等人。
她假模假样的安排了一个测试给他们，过关之后，天河等人进入了琼华派，成了琼华弟子，而紫英成为他们的师叔，负责教他们武功。
于是，这之后，仙剑4的4位主角：紫英，天河，梦璃，菱纱就走到了一起。
开始的时候，紫英一心修仙，而且总是一副冰块脸，但是大家能看得出，其实，他是个很热心也很重感情的人。菱纱就特别喜欢逗他，还送给紫英一个很珍贵的剑穗，因为她觉得，拿人家的手短，紫英收了她的东西，就不会那么霸道了。后来的一个晚上，望舒剑出特别的光，天河等人跟随望舒剑来到禁地，因为玄霄被关在禁地里，他的羲和剑也在这里。望舒感受到羲和的召唤，而来到禁地。
在这里见到了玄霄。玄霄跟天河很谈得来。于是，天河决定帮助玄霄冲出冰封。玄霄教天河凝冰决，是一种极寒的功法，玄霄用以克制羲和的侵害。
他们四人便根据指示去清风涧找到了两位长老，而这两位德高望重的长老正是当年冰封玄霄的参与者。由于心中有愧，两人便告诉他们如何寻得三件寒器。四人历经艰险，一路降妖伏魔，切身感到了六界生灵的亲情、友情、爱情终于帮助玄霄找到了3样至寒之宝（每件寒器的寻得正好对应着亲情、友情和爱情）。
玄霄也很感动天河的做为，与天河结成兄弟。尽管他知道天河是昔日他好朋友的儿子。找这三件寒器的过程中，紫英，天河，梦璃，菱纱4人的关系也越来越好，成为好朋友，而天河，梦璃，菱纱在这之中经历了很多事，他们现，修仙不过是一个美好的幻想，心不善，就修不成仙，悟出了妖法邪魔都不可怕，人的争斗之心才最可怕的道理。而琼华派中存在太多**和争斗，而且，为了修仙不择手段，甚至不去救近在山下的那些干旱的百姓。
他们渐渐对琼华派失望，决定一旦玄霄冲出冰封，他们就离开琼华派。而作为一直在琼华派长大的紫英，一直是琼华的忠实卫道者，此时也对琼华的所为感到疑惑。
19年一轮回的妖界又来到了琼华派的上空。此时，玄霄即将冲出冰封，他先利用云天河的天真纯善，骗到了天河的望舒剑，使得望舒剑与羲和剑终于再次相逢。然后他冲出了冰封，与可恶的掌门夙瑶一起，玄霄使羲和，夙瑶持望舒，再结剑网，将妖界束缚住。
此时的妖界经历了19年前的浩劫，已经无力与琼华派抗争。他们的妖界之主只好用最后的灵力结了一个强大的结界。企图阻止琼华派攻入。
由于望舒剑被不断使用，菱纱的身体也越来越弱。就在此时，梦璃恢复了对妖界的记忆，她明白了自己的来历，自己是妖界的少主，她不愿意看到自己的族人被杀戮，于是她决定回去。
于是，她对天河表白了自己的感情——她一直喜欢天河。但是，天河不解世事，也不懂情，再加上对菱纱的羁绊，没有做出回应，之后她跳入了妖界的结界。
天河追了过来，拼命想冲进妖界，却无法冲破。之后通过清风涧两位长老的帮忙，他们得知，只要去鬼界拿到翳影枝就能直接进入妖界。于是他们辗转进入鬼界。进入鬼界前，在不周山上他们结识了衔烛之龙。衔烛之龙很欣赏天河，于是给了他神龙之息，是一种极阳气息。而天河不畏阴，不惧阳的特殊体质在有了它之后便能青春常驻，延年长寿。
进入鬼界后，天河见到了自己死去的父亲，了解了当年的真相。而菱纱在逃离鬼界的船上见到了操舵的伯父，于是知道了自己的族人都是短命的原因——他们都是盗墓贼，惊扰了亡灵，必遭天遣，其他族人也在鬼界的其他地方赎罪。因此他们一族的人都活不过3o岁，而且死了还要在阴间做苦役，用以还债。
知道了事情的真相，菱纱反而坦然了。他们决定阻止玄霄等人的图谋。
此时，菱纱知道天河善于用弓，于是，她说服了云天河和慕容紫英，冒着自己再减阳寿的危险，去了封神陵，结果只是为了把威力巨大的神器后羿射日弓送给天河，并告诉他以后就算自己不在了也可以因为这把弓永远记住自己，这让一向木讷的天河感动的像个孩子一样泪流满面。
然后他们进入了妖界，见到了已经成为少主的梦璃。看到梦璃没事，也就放心了。可是就在此时，玄霄由于受羲和剑的入侵，再加上3件寒器的冲突，已经走火入魔，进了邪道。他的能力巨大。妖界的结界在玄霄面前弱不经风，很快被突破。琼华弟子再次冲入妖界，大肆抢夺充满灵力的紫晶石，并大量屠杀妖界的妖。
紫英阻拦他们，他们反诬紫英是叛徒。想要杀紫英，后来，一人偷袭紫英，一直对紫英很敬仰的怀朔替紫英挡了一剑而死，这导致紫英愤然决定退出这个已经全都入了邪的琼华派。
在玄霄他们抢夺了足够的紫晶石之后，才将双剑撤去。妖界得以解脱。梦璃接替她的母亲——妖界之主，成了妖界的主人。在梦璃不得不离开天河时，她母亲做了一个跟梦璃一模一样的傀儡跟随着天河他们。这个人只是梦璃和天河他们的一个梦，如果他们将梦璃忘却，这个假“梦璃”就会消散。
之后，天河，菱纱，紫英，以及假“梦璃”一起回到青鸾峰，找破解双剑的方法。以阻止玄霄的琼华派继续飞升。在青鸾峰天河住的小屋里。菱纱对天河表白了自己的感情，希望能跟天河一起终老在青鸾峰上。天河内心对菱纱更加依赖了。
之后，三人赶去已经破败不堪的琼华派。在这里与玄霄夙瑶等人生大战。玄霄虽然入了魔，但还是保存着一点良知，他顾念与天河的兄弟之情，没有对天河下杀手。但是天河依然受了重伤。
正在此时，琼华派已经飞升到了天光之处。突然，天神九天玄女告知玄霄，他已入邪，不准成仙，并把整个琼华派弟子贬到了东海最深处，而琼华派却会被天火焚毁。
可是此时，云天河却现了这个“上天的惩罚”中的大问题。那就是，如果琼华派被天火焚毁，那山下的普通百姓也必会被坠落的琼华派所威胁。
天河不愿这么多无辜百姓受连累，质问上天的这个惩罚，是否又考虑到了百姓的生计。
九天玄女提醒天河：你的手中有后羿射日弓，一切由你说了算。
玄霄最后也提醒天河：如果使用了越自己的力量，必会付出代价，让天河自己选择。
天河选择了拯救百姓，他想起了父亲生前常说的那句话：“我命由我不由天！”在救下晕倒的紫英和菱纱后拿起后羿射日弓，以自己体内的神龙之息，向坠落的琼华派射出了天河剑，将琼华派一举毁灭。
但天河以凡人之身动用神器，如玄霄所说，是需要付出代价的。其代价就是——自身受到神弓反噬，使他的双眼永远的失去了光明。
百年之后，梦璃回到了人间，在青鸾峰顶，她见到了白苍苍的慕容紫英，天河爱妻菱纱的墓和年少如故却已经看不见了的天河。